每年的11－12月份，是海灣扇貝養成的集中收獲期。因為這時海水溫度已下降到近10℃,海水中扇貝的餌料生物逐漸減少，扇貝自身的攝食活動也變得十分緩慢，因此扇貝開始逐漸消瘦。所以，到了11月中下旬就應該抓緊收獲。即使沒有達到商品規格也應全部收獲（除留種貝之外）。因為海灣扇貝中越冬的貝中冬季停止生長，等到時翌年春季便大量死亡。所以，海灣扇貝必須是當年養成，當年一次收獲。
海灣扇貝當年收獲每百千克扇貝鮮貝柱出成率，在肥沃海區可達13％－15％，瘠區僅為9％－12％。收獲的海灣扇貝要抓緊加工鮮柱，要邊收邊加工，盡量不要堆積過夜，以免影響出柱率和貝柱質量。海灣扇貝盡量不要加工“干貝”，因為海灣扇貝生長快、貝柱鮮嫩透明、加工鮮柱很受市場歡迎。若加工干貝不僅干品率低，而且干貝形狀色澤不美。