蝎子是傳統的藥用動物，以蝎為主劑配制的中成藥達30多種，蝎是國內外緊缺的名貴中藥材，主治風疹及中風、半身不遂、口眼歪邪、語澀、手足抽搐等。我國現在已能提取蝎毒并進行提純分離，已試用于癌癥、心臟病和神經系統疾病治療。
在中藥上，將干燥后的蝎全體入藥稱為全蝎或全蟲。市場上出售的全蝎有兩種加工方法。
1、咸全蝎加工方法。首先將蝎子放入冷水中，洗凈粘附在身上的泥土和排出糞便，但時間不宜過長，不要把蝎子淹死。然后按每千克活蝎用鹽120-200克，將鹽溶解在2-3千克的清水中，撈出活蝎放到鹽水里，很快就被淹死。在鹽水中浸泡8-10小時撈出蝎子，再將鹽水澄清，倒入大鐵鍋中煮開，隨即再將撈出的蝎子放入沸鹽水煮10-20分鐘。最后將蝎撈出，攤在草簾或席子上放在通風處陰干，即成咸全蝎。
2、淡全蝎加工方法。適量水中加放少許鹽，一般按每千克活蝎用鹽30克，把鹽水煮開，將蝎放冷水中洗凈，隨即將洗凈的活蝎放入沸鹽水中煮，待水再次沸騰時即可撈出，曬干即成淡全蝎。
咸全蝎夏天反鹵易掉腿，甚至破碎，但能防蟲蛀，淡全蝎較完整，但易被蟲蛀。